Claude, CRISPR를 연상시키는 새로운 효소 시스템 찾아

AI 요약

Anthropic이 생명과학 연구 그룹과 실험실을 신설하고, Claude를 활용해 DNA 데이터에서 미지의 단백질 계열을 찾는 연구를 시작했습니다. 초기 연구에서 Claude는 CRISPR와 비슷한 반복 서열 배열을 가진 효소 시스템 후보를 찾아냈습니다. 연구팀은 이 시스템을 array-associated reverse transcriptases(ART)라고 부릅니다.

데이터베이스 탐색부터 실험까지

연구팀은 Claude에 역전사효소(reverse transcriptase, RT) 후보를 찾아보라고 지시했습니다. 이후 약 950개의 에이전트가 21시간 동안 2억 1천만 토큰을 사용해 데이터를 살폈습니다. Claude는 20만 개가 넘는 RT를 모으고, 새로운 시스템 후보 3,500개를 추린 뒤, 그중 유력한 후보 20개를 분석해 사람이 읽을 수 있는 보고서를 작성했습니다. 이 과정에서 한 에이전트가 특이한 RT 주변에서 반복되는 DNA 배열을 발견했습니다.

연구팀은 후보를 검토한 뒤 실험실에서 단백질을 발현시키고 생화학적·구조적 특성을 조사했습니다. ART는 주로 세균을 감염하는 바이러스인 박테리오파지에서 발견되며, RT와 인접한 단백질 유전자, 일정한 간격으로 이어지는 DNA 반복 배열로 구성됩니다. 초기 실험에서는 반복 배열이 서로 다른 짧은 RNA로 발현되는 점을 확인했습니다.

기능은 아직 미확인

RT 자체는 이전 연구에서 발견됐지만, Claude가 RT 주변의 비암호화 DNA 배열과 기능을 모르는 보조 단백질을 함께 살펴 시스템의 특징을 짚어낸 것은 이번이 처음이라고 Anthropic은 설명합니다. 다만 연구팀은 ART가 무엇을 하는지 아직 모릅니다. 배열이 CRISPR처럼 여러 RNA 서열을 담아 작동하는지도 확인되지 않았습니다. 현재 공개한 결과는 후보 시스템과 RNA 발현을 제시한 초기 단계이며, 기능을 규명하는 실험은 진행 중입니다.

연구팀은 후보 보고서를 대량으로 만든 뒤, 사람이 실험 대상으로 고르는 기준을 분석해 Claude의 지침에 반영한다고 밝혔습니다. 실험은 사람이 수행하며, 연구실은 BSL-1·BSL-2 수준의 작업만 하고 사람을 감염시키는 병원체는 다루지 않는다고 덧붙였습니다. 이번 결과를 담은 프리프린트도 공개했습니다.

Reddit 반응

• @u/Fearless-Effect-8742 — 이제 과학적 발견이 빠르게 이어지는 시기에 들어서기를 바랍니다.
  • @u/No-Assumption-4468 — AI로 마침내 질병을 치료하기 시작한다면 정말 기쁠 것 같습니다.
  • @u/Laughing-Comanche — 코로나19 mRNA 백신은 AI 데이터 분석으로 나왔습니다.
  • @u/Fleetfox17 — 의료 분야에서는 1970년대부터 머신러닝을 사용했습니다.
  • @u/wattro — AI가 뭔지 아는 사람은 없습니다. 수십 년 동안 AI를 써왔다는 사실도 모릅니다. 대부분 AI를 LLM과 같은 말로 생각합니다.
• @u/Neurogence — GPT-6의 의견입니다. AI가 독창적인 발견에 기여했다는 근거는 상당하지만, 아직 AlphaFold 2 수준의 과학적 돌파구는 아닙니다. Anthropic도 ART의 기능을 모른다고 분명히 밝혔습니다. 실험 결과는 배열에서 짧은 RNA가 만들어진다는 점이지, 이를 이용한 유전자 편집이 가능하다는 점이 아닙니다. 제가 가장 흥미롭게 보는 부분은 과학적 판단을 맡겼다는 점입니다. 보고서에 따르면 Claude는 특이한 후보를 고르고, 놓쳤던 패턴을 알아차리고, 기존 연구를 확인한 뒤 사람이 검증하도록 가져왔습니다. 연구 동료로 기능하는 AI에 한 걸음 다가간 사례입니다. 효소의 실제 중요성은 아직 불확실하지만, 연구 역량은 이미 의미가 있습니다.
  • @u/Deto — 지금 당장 가능한 장점은 이런 시스템으로 방대한 데이터셋을 지능적으로 훑고 관심 대상을 표시하는 일이라고 봅니다. 아직 발견되지 않은 것이 많이 숨어 있을 겁니다.
• @u/vhu9644 — 아직 너무 미완성인 느낌입니다. 반복 배열을 찾았고 짧은 RNA로 만들어진다는 점까지 확인했는데, 그다음은 없습니다. 반복 배열과 RNA 발현은 살펴볼 만한 전형적인 특징입니다. 최근 VIPR 같은 연구를 보면 비슷한 분석도 있습니다. 이 정도의 부분 결과는 논문으로 내기 어려워 보이고, 분석도 새롭지 않아 보입니다. 흥미로운 서열 모티프를 찾았다는 점 말고는 특별해 보이지 않습니다. 제가 뭔가 놓친 건가요?
  • @u/space_monster — 완성된 연구라고 내세우는 건 아닙니다. 이 글은 결과보다 연구 과정에 초점을 둡니다.
• @u/CardGameFanboy — 유전학과 분자생물학 박사입니다. 이건 사실상 아무것도 아닙니다. 기능을 시험하거나 설명하지 않았고, 무엇을 발견했는지, 흥미로운 대상인지조차 모릅니다. 과학적 발견의 첫 단계인 가설 생성에 불과합니다.
• @u/Illustrious_Image967 — 기능도 모르는 대상을 발표하는 건 무책임합니다. 누군가 집에서 만들어 생물학적 재앙을 일으키면 어떡합니까?
  • @u/FoodMadeFromRobots — 작동 방식도 모르고 CRISPR도 이미 있는데, 뒷마당의 생물학 테러범이 조만간 이걸 쓸 것 같지는 않습니다.
  • @u/vhu9644 — 위험한 발표라고 생각하지 않습니다. 박테리오파지와 관련된 시스템이라 병원성은 없을 것 같습니다.

원문: Anthropic / 번역·요약: Trawling